以红蜘蛛、锈壁虱、蚧壳虫、蚜虫、潜叶蛾、疮痂病为重点进行综合防治，冬季用0.5度－1度石硫合剂做好清园，3月－10月根据病虫害的发生情况，做好适合科学防治，常用农药波尔多液、托布津、奥欣、杀螨酮、乐斯本、吡虫啉、灭扫利等。
炭疽病
加强栽培管理，防止偏施氮肥；春、夏梢抽发期和果实成熟前，可选用代森锰锌、松枝酸铜、代森锌、百菌清等喷布树冠，15天左右喷一次，连续3-4次。
脚腐病
及时排水，改善园内透光通风条件，加强对天牛和其他树干害虫的防治；选用枳、枳橙、香橙等抗病砧木，对已感病植株，可用抗病砧木接换砧。药剂防止：刮除病斑后涂药，常用药剂有多菌灵、甲基托布津等。
螨类
（柑桔红蜘蛛、四斑黄蜘蛛锈壁虱）。开花前后（3-5月）和秋季（9-11月）是防治红蜘蛛的重点时期：花前虫口密度达1-2头/叶，花后和秋季达5-6头/叶即需进行防治。春梢抽发期、幼果期和果实膨大期为锈虱防治主要时期：当年生春梢叶背初现铁锈色；叶或果上虫口密度达每叶2-3头时即时防治。常用药剂有噻螨酮、达螨灵、炔螨特、溴螨酯、双甲眯等，注意保护长须螨、钝螨、食螨瓢虫、日本方头甲和草蛉等天敌。[2]
蚧类
（矢尖蚧、红蜡蚧、吹棉蚧等）。药物防治重点时期：矢尖蚧为第一代若虫期，红蜡蚧为幼虫期大量上梢为害时期（一般为5月上、中旬至6月中旬），吹棉蚧为幼虫盛发阶段。常用药剂阴噻嗪酮、杀扑磷、苦参碱+烟碱、乐斯本、机油乳剂等。注意改善园内通风透光条件；保护和利用日本方头甲、红点唇瓢虫、草蛉、黄金蚜小蜂、澳洲瓢虫、大红瓢虫等天敌。
蚜虫
新梢被害率达25%，应即时喷药防治。常用药剂有叮虫脒、乐果、丁硫克威等。应注意保护七星瓢虫、大草蛉、食蚜蝇、蚜小蜂等，剪除越冬虫卵，减少害虫基数。
潜叶蛾
防治的重点时期为夏、秋梢抽发期（7月上中旬）。及时抹除零星抽发的夏秋梢，结合肥水管理，促使植株抽发的新梢健壮整齐。药剂防治：新梢抽发至1-2cm时喷药，7-10天喷一次，连续2-3次。常用药剂有阿维菌素、杀螟丹、氯氟氰菊酯等。
天牛类
5-8月，晴天中午人工捕杀星天牛和绿桔天牛成虫，傍晚捕杀褐天牛成虫；及时削除虫卵、初孵幼虫和剪除被害枝梢；用棉花或棉纱浸湿乐果等杀虫剂原药后堵塞虫孔，再将虫孔用泥土封闭，以毒杀幼虫。
花蕾蛆
现蕾时选用甲敌粉、二嗪农颗粒等加细土混匀后撒施于树盘土面，每7天一次，连续2-3次；当花蕾直径为2-3mm时（现白时）选用硫磷、敌百虫等喷树冠；尽早摘除受害花蕾，集中深埋或煮沸；冬季深翻园土，可消灭部分越冬害虫蛹。